Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PITRM1Q5JRX3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PITRM1Q5JRX3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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