Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TDRD12Q587J7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TDRD12Q587J7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms