Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LONRF3Q496Y0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LONRF3Q496Y0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms