Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

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Length 58 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KRTAP21-3Q3LHN1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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KRTAP21-3Q3LHN1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
KRTAP21-3Q3LHN1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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