Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHD9Q3L8U1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHD9Q3L8U1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
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