Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MSMPQ1L6U9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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