Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KNOP1Q1ED39 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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