Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IMPG1Q17R60 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IMPG1Q17R60 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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