Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDO1Q16878 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDO1Q16878 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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