Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ATP6AP1Q15904 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ATP6AP1Q15904 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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