Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN9AQ15858 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN9AQ15858 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
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