Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TRAM1Q15629 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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