Protein–RNA interactions for Protein: Q15526

SURF1, Surfeit locus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF1Q15526 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SURF1Q15526 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SURF1Q15526 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms