Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CDSNQ15517 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDSNQ15517 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms