Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYCP1Q15431 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SYCP1Q15431 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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