Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 DLEU1-207ENST00000467721 1455 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.496e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 SERPINA3-201ENST00000393078 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.51e-15■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-231ENST00000490577 2440 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.516e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-217ENST00000474630 518 ntTSL 511.79□□□□□ -0.526e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 AC022384.1-201ENST00000437082 2270 ntAPPRIS P5 TSL 211.79□□□□□ -0.522e-8■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-209ENST00000468522 1158 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.536e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 SERPINA3-206ENST00000555820 981 ntTSL 511.47□□□□□ -0.571e-15■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-206ENST00000463474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.76e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-234ENST00000491615 1451 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.716e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-227ENST00000484869 1652 ntTSL 510.15□□□□□ -0.796e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 LINC00852-202ENST00000538717 1327 nt10.13□□□□□ -0.792e-8■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.812e-8■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-228ENST00000485007 736 ntTSL 59.8□□□□□ -0.846e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 SERPINA3-207ENST00000556388 480 ntTSL 49.69□□□□□ -0.861e-15■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 SERPINA3-205ENST00000485588 575 ntTSL 1 (best)9.61□□□□□ -0.871e-15■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 AL137230.2-201ENST00000555070 452 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.95e-12■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 AL049839.2-201ENST00000553947 3067 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.931e-15■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 EIF2AK1-209ENST00000490523 905 ntTSL 28.98□□□□□ -0.971e-15■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-223ENST00000483169 1304 ntTSL 28.62□□□□□ -1.036e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-211ENST00000469127 320 ntTSL 58.52□□□□□ -1.056e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-222ENST00000480262 566 ntTSL 1 (best)8.52□□□□□ -1.056e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-214ENST00000470726 508 ntTSL 58.52□□□□□ -1.056e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 DLEU1-221ENST00000479420 612 ntTSL 56.58□□□□□ -1.366e-6■■■■□ 23.8
PCBP1Q15365 PPFIA3-205ENST00000602509 547 ntTSL 429.22■■■□□ 2.271e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 MVK-203ENST00000447878 1644 ntTSL 227.64■■■□□ 2.021e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 FBRSL1-204ENST00000539264 409 ntTSL 226.59■■□□□ 1.851e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 FBRSL1-207ENST00000543360 238 ntTSL 226.23■■□□□ 1.791e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 PPFIA3-208ENST00000602726 805 ntTSL 224.29■■□□□ 1.481e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 GTPBP3-221ENST00000600610 1105 ntTSL 1 (best)22.98■■□□□ 1.271e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 PPFIA3-204ENST00000602492 740 ntTSL 422.53■■□□□ 1.21e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 RNF220-209ENST00000474064 2734 ntTSL 222.08■■□□□ 1.123e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 TCF3-213ENST00000590436 1149 ntTSL 521.94■■□□□ 1.11e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 TCF3-206ENST00000585855 1170 ntTSL 321.94■■□□□ 1.11e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 GTPBP3-213ENST00000596166 1024 ntTSL 320.78■□□□□ 0.921e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 TCF3-207ENST00000586164 409 ntTSL 320.08■□□□□ 0.811e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 DUS1L-204ENST00000542088 1040 ntTSL 320■□□□□ 0.791e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.781e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.751e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 SMG1-203ENST00000532700 1259 ntTSL 219.69■□□□□ 0.741e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 DUS1L-203ENST00000538833 1250 ntTSL 1 (best)19.54■□□□□ 0.721e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 MVK-216ENST00000636996 1725 ntTSL 519.52■□□□□ 0.721e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 PPFIA3-202ENST00000421230 2236 ntTSL 219.28■□□□□ 0.681e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.671e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.651e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.651e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.591e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 PPFIA3-207ENST00000602716 2020 ntTSL 1 (best)18.71■□□□□ 0.591e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.571e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 DUS1L-213ENST00000580731 725 ntTSL 518.53■□□□□ 0.561e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.541e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.511e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.511e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 TCF3-215ENST00000590684 1313 ntTSL 317.98■□□□□ 0.471e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.461e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 MVK-215ENST00000636529 1509 ntTSL 517.9■□□□□ 0.461e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 RNF220-214ENST00000484745 1951 ntTSL 517.53■□□□□ 0.43e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 DUS1L-209ENST00000578428 688 ntTSL 217.46■□□□□ 0.391e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.391e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 RBCK1-209ENST00000415942 2613 ntTSL 517■□□□□ 0.311e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.261e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 TRAPPC1-207ENST00000575639 561 ntTSL 216.61■□□□□ 0.251e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.211e-7■■■■□ 23.7
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PCBP1Q15365 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.181e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.171e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 GTPBP3-207ENST00000594703 553 ntTSL 415.98■□□□□ 0.151e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 RBCK1-204ENST00000382214 2752 ntTSL 1 (best)15.96■□□□□ 0.151e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.141e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.131e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 TCF3-205ENST00000585731 1222 ntTSL 215.74■□□□□ 0.111e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 DUS1L-212ENST00000579854 657 ntTSL 215.68■□□□□ 0.11e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 PPFIA3-206ENST00000602655 3493 ntTSL 1 (best)15.26■□□□□ 0.031e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 CAMTA2-206ENST00000572192 856 ntTSL 215.09■□□□□ 0.011e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -01e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.011e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.011e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 DUS1L-210ENST00000578846 4456 ntTSL 215□□□□□ -0.011e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 DUS1L-216ENST00000584871 676 ntTSL 214.5□□□□□ -0.091e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.153e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.153e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 MVK-202ENST00000392727 1770 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.211e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 RNF220-202ENST00000355387 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.273e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 PIGS-201ENST00000268758 2397 ntTSL 212.99□□□□□ -0.331e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.331e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.341e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.341e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 AES-208ENST00000587083 458 ntTSL 212.87□□□□□ -0.351e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 RNF220-211ENST00000474956 3303 ntTSL 212.73□□□□□ -0.373e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.381e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.411e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 RNF220-213ENST00000480686 3835 ntTSL 212.36□□□□□ -0.433e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 PIGS-206ENST00000487231 3088 ntTSL 1 (best)12.25□□□□□ -0.451e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 PIGS-207ENST00000492429 2658 ntTSL 210.51□□□□□ -0.731e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 MVK-209ENST00000540353 4109 ntTSL 210.43□□□□□ -0.741e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 TRAPPC1-202ENST00000540486 759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.861e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 TRAPPC1-203ENST00000571739 648 ntTSL 39.6□□□□□ -0.871e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.91e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.981e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.111e-7■■■■□ 23.7
PCBP1Q15365 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.191e-7■■■■□ 23.7
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