Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BRD3Q15059 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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