Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPSQ13938 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPSQ13938 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CAPSQ13938 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPSQ13938 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPSQ13938 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPSQ13938 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPSQ13938 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPSQ13938 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPSQ13938 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPSQ13938 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPSQ13938 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPSQ13938 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPSQ13938 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPSQ13938 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPSQ13938 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
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