Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FHL3Q13643 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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