Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTCH1Q13635 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTCH1Q13635 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
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