Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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TMED1Q13445 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
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TMED1Q13445 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TMED1Q13445 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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