Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATMQ13315 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATMQ13315 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATMQ13315 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATMQ13315 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATMQ13315 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ATMQ13315 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATMQ13315 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATMQ13315 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATMQ13315 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATMQ13315 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATMQ13315 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATMQ13315 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATMQ13315 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATMQ13315 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ATMQ13315 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATMQ13315 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATMQ13315 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATMQ13315 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATMQ13315 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATMQ13315 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATMQ13315 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATMQ13315 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATMQ13315 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATMQ13315 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATMQ13315 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATMQ13315 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATMQ13315 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATMQ13315 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATMQ13315 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATMQ13315 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATMQ13315 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATMQ13315 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATMQ13315 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATMQ13315 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATMQ13315 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATMQ13315 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATMQ13315 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATMQ13315 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATMQ13315 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATMQ13315 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATMQ13315 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATMQ13315 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATMQ13315 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATMQ13315 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATMQ13315 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATMQ13315 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATMQ13315 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATMQ13315 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATMQ13315 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATMQ13315 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATMQ13315 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATMQ13315 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATMQ13315 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATMQ13315 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATMQ13315 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATMQ13315 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATMQ13315 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATMQ13315 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATMQ13315 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATMQ13315 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATMQ13315 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATMQ13315 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATMQ13315 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATMQ13315 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATMQ13315 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATMQ13315 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATMQ13315 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATMQ13315 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATMQ13315 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATMQ13315 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATMQ13315 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATMQ13315 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATMQ13315 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATMQ13315 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATMQ13315 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATMQ13315 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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