Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SKP2Q13309 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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SKP2Q13309 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SKP2Q13309 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
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