Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAF3Q13114 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAF3Q13114 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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