Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHAF1BQ13112 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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CHAF1BQ13112 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
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CHAF1BQ13112 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CHAF1BQ13112 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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CHAF1BQ13112 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHAF1BQ13112 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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