Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHAF1AQ13111 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
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