Protein–RNA interactions for Protein: Q13103

SPP2, Secreted phosphoprotein 24, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP2Q13103 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SPP2Q13103 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SPP2Q13103 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms