Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CSTF3Q12996 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CSTF3Q12996 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
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