Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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NPRL3Q12980 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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NPRL3Q12980 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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NPRL3Q12980 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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NPRL3Q12980 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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NPRL3Q12980 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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NPRL3Q12980 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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NPRL3Q12980 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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NPRL3Q12980 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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NPRL3Q12980 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
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NPRL3Q12980 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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NPRL3Q12980 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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NPRL3Q12980 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NPRL3Q12980 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NPRL3Q12980 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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