Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
FOXD4Q12950 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
FOXD4Q12950 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms