Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CKAP4Q07065 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CKAP4Q07065 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms