Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHRNB3Q05901 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CHRNB3Q05901 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms