Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRKCDQ05655 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms