Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSBP1Q04837 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSBP1Q04837 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms