Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BNC1Q01954 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BNC1Q01954 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms