Protein–RNA interactions for Protein: Q01851

POU4F1, POU domain, class 4, transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU4F1Q01851 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
POU4F1Q01851 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POU4F1Q01851 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms