Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
PRCDQ00LT1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms