Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUCB2P80303 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUCB2P80303 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms