Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ASIC1P78348 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ASIC1P78348 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms