Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN2AP68543 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN2AP68543 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms