Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SNRPD1P62314 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNRPD1P62314 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms