Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UBE2HP62256 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
UBE2HP62256 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms