Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
AP1S1P61966 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AP1S1P61966 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms