Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
POLR2FP61218 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2FP61218 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms