Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
LINC00313P59037 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LINC00313P59037 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms