Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CABP4P57796 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CABP4P57796 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CABP4P57796 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CABP4P57796 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CABP4P57796 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CABP4P57796 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CABP4P57796 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CABP4P57796 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CABP4P57796 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CABP4P57796 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CABP4P57796 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CABP4P57796 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CABP4P57796 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CABP4P57796 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CABP4P57796 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CABP4P57796 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CABP4P57796 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CABP4P57796 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CABP4P57796 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CABP4P57796 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CABP4P57796 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CABP4P57796 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CABP4P57796 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CABP4P57796 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CABP4P57796 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CABP4P57796 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CABP4P57796 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CABP4P57796 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CABP4P57796 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP4P57796 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP4P57796 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP4P57796 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP4P57796 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP4P57796 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP4P57796 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP4P57796 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP4P57796 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP4P57796 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP4P57796 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP4P57796 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP4P57796 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP4P57796 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CABP4P57796 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CABP4P57796 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CABP4P57796 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CABP4P57796 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CABP4P57796 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CABP4P57796 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CABP4P57796 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP4P57796 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP4P57796 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP4P57796 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP4P57796 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP4P57796 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP4P57796 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP4P57796 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP4P57796 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP4P57796 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP4P57796 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP4P57796 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP4P57796 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP4P57796 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CABP4P57796 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CABP4P57796 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CABP4P57796 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CABP4P57796 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CABP4P57796 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CABP4P57796 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CABP4P57796 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CABP4P57796 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CABP4P57796 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CABP4P57796 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CABP4P57796 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CABP4P57796 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CABP4P57796 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CABP4P57796 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CABP4P57796 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CABP4P57796 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CABP4P57796 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CABP4P57796 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CABP4P57796 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CABP4P57796 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CABP4P57796 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CABP4P57796 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CABP4P57796 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CABP4P57796 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CABP4P57796 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CABP4P57796 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CABP4P57796 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CABP4P57796 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CABP4P57796 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CABP4P57796 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CABP4P57796 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CABP4P57796 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CABP4P57796 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CABP4P57796 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CABP4P57796 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CABP4P57796 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CABP4P57796 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms