Protein–RNA interactions for Protein: P57082

TBX4, T-box transcription factor TBX4, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX4P57082 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TBX4P57082 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TBX4P57082 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX4P57082 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX4P57082 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX4P57082 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX4P57082 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX4P57082 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX4P57082 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX4P57082 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX4P57082 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX4P57082 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX4P57082 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX4P57082 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX4P57082 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX4P57082 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX4P57082 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TBX4P57082 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TBX4P57082 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX4P57082 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX4P57082 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX4P57082 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX4P57082 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX4P57082 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX4P57082 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX4P57082 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX4P57082 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX4P57082 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TBX4P57082 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX4P57082 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX4P57082 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX4P57082 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX4P57082 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX4P57082 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX4P57082 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX4P57082 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX4P57082 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX4P57082 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX4P57082 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX4P57082 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX4P57082 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX4P57082 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX4P57082 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TBX4P57082 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX4P57082 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX4P57082 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX4P57082 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX4P57082 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX4P57082 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX4P57082 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX4P57082 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX4P57082 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX4P57082 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX4P57082 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX4P57082 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX4P57082 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX4P57082 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX4P57082 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX4P57082 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX4P57082 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TBX4P57082 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX4P57082 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX4P57082 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX4P57082 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX4P57082 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX4P57082 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX4P57082 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX4P57082 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX4P57082 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX4P57082 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX4P57082 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX4P57082 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX4P57082 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX4P57082 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TBX4P57082 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBX4P57082 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBX4P57082 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBX4P57082 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TBX4P57082 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms