Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLE2P56282 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLE2P56282 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
POLE2P56282 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE2P56282 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE2P56282 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE2P56282 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE2P56282 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE2P56282 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE2P56282 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE2P56282 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE2P56282 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE2P56282 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE2P56282 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE2P56282 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
POLE2P56282 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
POLE2P56282 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
POLE2P56282 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
POLE2P56282 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLE2P56282 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLE2P56282 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLE2P56282 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLE2P56282 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLE2P56282 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLE2P56282 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
POLE2P56282 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE2P56282 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE2P56282 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
POLE2P56282 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms