Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH8P55286 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH8P55286 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH8P55286 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH8P55286 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH8P55286 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH8P55286 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH8P55286 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH8P55286 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH8P55286 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH8P55286 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH8P55286 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH8P55286 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH8P55286 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH8P55286 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH8P55286 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH8P55286 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH8P55286 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH8P55286 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH8P55286 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH8P55286 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH8P55286 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH8P55286 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH8P55286 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH8P55286 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH8P55286 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH8P55286 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH8P55286 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH8P55286 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH8P55286 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH8P55286 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH8P55286 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH8P55286 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH8P55286 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH8P55286 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH8P55286 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH8P55286 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH8P55286 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH8P55286 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH8P55286 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH8P55286 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH8P55286 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH8P55286 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH8P55286 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH8P55286 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH8P55286 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH8P55286 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH8P55286 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH8P55286 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH8P55286 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH8P55286 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH8P55286 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH8P55286 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH8P55286 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH8P55286 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH8P55286 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH8P55286 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH8P55286 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH8P55286 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH8P55286 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH8P55286 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH8P55286 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH8P55286 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH8P55286 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH8P55286 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH8P55286 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH8P55286 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH8P55286 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH8P55286 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH8P55286 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH8P55286 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH8P55286 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH8P55286 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH8P55286 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH8P55286 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH8P55286 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH8P55286 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH8P55286 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH8P55286 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH8P55286 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH8P55286 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH8P55286 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH8P55286 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH8P55286 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH8P55286 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH8P55286 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH8P55286 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH8P55286 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH8P55286 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH8P55286 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH8P55286 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH8P55286 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH8P55286 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH8P55286 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH8P55286 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH8P55286 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH8P55286 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH8P55286 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH8P55286 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH8P55286 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms