Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NCKAP1LP55160 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NCKAP1LP55160 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NCKAP1LP55160 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms